印度尼西亚境内苏拉威西海上的布西岛是海岛探险与旅游的胜地，也是当今世上最大的蜥蜴——科摩多龙仅存的国度。
科摩多龙，是早已灭绝的凶残的肉食性恐龙——霸王龙的远亲（并不是恐龙），在地球上已繁衍生息了3亿多年。其平均体长达3米，拥有尖牙与利爪，其口中成排的锯状尖齿能够轻而易举地将猎物身上的毛刮干净，而其长达10厘米的利爪，则可以不费吹灰之力划开猎物的胸膛。不过，最为恐怖的还是它拥有的“生物化学武器”——科摩多龙在它进食后总会将一些食物的碎屑留在牙缝里，静待其腐烂变质，产生毒素。除了它自己，世上没有任何一种生物能抵御该种合成毒素的侵袭。科摩多龙，几乎让所有印尼人都谈之变色，除了和它们共同生活在布西岛上的雅图族人。
雅图族人是惟一生活在布西岛上的人类，说不清是在多少年前，他们的祖先漂洋过海迁来此地并一代代繁衍生息，建立了如今拥有300多人的土著族群。他们将科摩多龙视为自己的“祖先”，视作心中至高无上的神。多少年来，雅图族人一直与科摩多龙和平相处，偶有科摩多龙吞噬族人的事故发生，他们也认为是该人有幸，蒙“祖先”之宠被召唤去了。
2004年10月下旬的一个上午，生活在布西岛上的一对雅图族青年男女卡吉亚与爱丝牵手走进密林深处。卡吉亚是雅图族族长的小儿子，也是全族中最受女孩们青睐的勇士。爱丝则是雅图族中最美丽的少女，年方17岁的她古铜色的肌肤漾出醉人的光泽，略为下凹的双眼深邃而明亮，长及腰臀的一头秀发更是飘逸如云。
今天，是卡吉亚和爱丝入“洞房”的大喜日子。按照雅图族的风俗，男女双方定情后必须先由男方在密林中选一洞穴，在洞中预备好生活用品和狩猎工具，然后将女方接过去。在以后的日子里，一直要靠男方独自打猎供养女方，直到女方怀孕后，两人方可回到部落，男方这才能正式向女方家长提亲，等孩子出生后举办盛大的婚宴。
40天很快过去了，爱丝也怀孕了。卡吉亚和爱丝本该马上携手回部落的，可那几天卡吉亚正在追踪一头公鹿，那头公鹿头上长着一对大得异乎寻常的鹿角，卡吉亚正需要这份大礼物向爱丝的父母提亲，于是两人商定等猎到那头公鹿后再回部落。
12月4日这天，卡吉亚终于一箭贯喉十分漂亮地射杀了那头公鹿。然而，当他锯下鹿角，用随身带的皮囊盛上从鹿角断处涌出的鹿血，一口气跑回山洞准备让爱丝趁热好好补一补时，眼前的一幕让他惊呆了：山洞里一片狼藉，四处沾染着未干的鲜血，而爱丝却不见踪影！卡吉亚猛然缓过神来扔下手中的皮囊疯了似的循着地上星星点点的血迹追了出去。
还没跑上200米，刚扒开面前的一簇长草，一幕血腥的场景让卡吉亚差点昏死过去——爱丝躺在不远处的一块大石边，一头科摩多龙已用利爪划开了她的肚皮，正津津有味地大啖着她的内脏！卡吉亚的眼珠都要往外喷火了，尽避他也相信科摩多龙是他们的“祖先”，可他无论如何不能接受这位“祖先”大肆吞噬爱丝的事实，而且，爱丝腹中已有了自己的骨肉啊！
杀妻食子仇，不可不报！卡吉亚强压住心头的怒火，屏住呼吸，从背后抽出一枝他从不轻易使用专门对付猛兽的重箭，使尽全身力气将弓拉成满月状，瞄准了科摩多龙凶残的左眼。随着一声凄厉的惨叫声，科摩多龙扔下嘴边的美食转身逃进林莽之中。
卡吉亚含泪掩埋了爱丝的尸体，在妻子坟前，他折断了一枝长箭发誓：此仇不报，誓不为人！
然而，当卡吉亚的家人知道了他的这一决定后，无一不极力反对，尤其是他的父亲努尔特。努尔特已当了23年族长，他十分清楚他的族人会如何处治伤害了科摩多龙的凶手，伤害“祖先”的前肢，要被砍下双手；伤害“祖先”的后肢，要被砍下双脚；致“祖先”于死地，则要被处以火刑……按照代代相传的习俗，卡吉亚已经犯下了要被挖去双眼的大罪，更别提他还想继续追杀那头独眼科摩多龙了。
卡吉亚毕竟是努尔特族长最疼爱的儿子，他马上在家中封锁了卡吉亚射瞎了科摩多龙左眼的消息，只对外宣布爱丝已被“祖先”召唤去了，然后，一面为爱丝举行隆重的祭祖仪式，一面为儿子留意族里其他的漂亮姑娘，希望他们中的一位能取代爱丝在卡吉亚心中的位置。
可是，当努尔特族长结束了长达七天的祭祖仪式回到家中时，他惊恐地发现，墙上那筒代表族长至高无上身份的铁头箭和卡吉亚收集了多年的一筒腹蛇毒液不见了，而卡吉亚也去向不明！
卡吉亚的确是追杀那头独眼科摩多龙去了。一连5天，他几乎找遍了科摩多龙可能出现的每一个地方，遇到了10多头科摩多龙，可偏偏没有发现瞎了左眼的“仇家”。
12月17日，卡吉亚无意中看见一头一瘸一跛的科摩多龙腿上糊着厚厚的烂泥，他恍然大悟：许多动物都有自己疗伤的本能，科摩多龙也不例外，看来，用烂泥浸泡伤口是它们的疗伤方法。想到这里，卡吉亚爬上一棵大树，一箭射中这头科摩多龙的左前腿。现在，他只要紧跟着这头受伤的科摩多龙，就能够找到它们疗伤的泥潭了！穿过密林，踏过荆棘，趟过沼泽，在一个僻静的小山谷里，疲惫不堪的卡吉亚终于发现了仇家——独眼科摩多龙。此时，它左眼上的重箭已被弄掉，正趴在一汪乌黑的泥潭边，微侧着脑袋，将左眼浸在烂泥里疗伤。大概是难以忍受揪心的疼痛吧，它不时发出几声低吼，还不时用尾巴重重砸着地面。卡吉亚悄悄抽出一枝用腹蛇毒液浸泡过的铁头箭，可犹豫了片刻，他又轻轻将箭插了回去。卡吉亚明白，自己所在的位置离独眼科摩多龙太远，要将其一箭毙命把握不大，而泥潭边还有好几头疗伤的科摩多龙，万一惊动了它们，自己非但报不了仇，恐怕生命也将难保。可泥潭四周光秃秃的，要想接近独眼科摩多龙又不被发现，看来是办不到了。如今之计只有等，等独眼科摩多龙走出小山谷后再动手。卡吉亚躲在小山谷外的一棵大树上一等就是几天，饿了，就吃一点随身带的鹿肉干，渴了，就喝一口皮囊中的水。但他不能合眼，因为他不能让独眼科摩多龙从自己眼皮底下溜走，他要等待时机报仇！
12月23日，为了疗伤已半个多月未进食的独眼科摩多龙终于耐不住饥饿，走出了小山谷。惟恐被它发现，卡吉亚不敢在地面上跟踪它，只好像一只灵活的大猴子从一棵树爬到另一棵树，在空中远远地追踪。
终于，为了追捕一头貘，独眼科摩多龙走出了它们聚居的地盘。机会来了！当独眼科摩多龙前腿直立，后腿微屈准备向貘凌空一扑时，卡吉亚对准它的双目之间狠狠地射了一箭。当铁头箭刚刚离开弓弦之时，独眼科摩多龙也一跃而起向貘扑去。于是，本可贯脑的一箭偏偏扎在了它的脊背上。尽避独眼科摩多龙逃过了致命的一击，可锋利的铁头箭加上卡吉亚惊人的臂力还是使它受到了重创，箭身没入它的身体15厘米之深。独眼科摩多龙似乎发现情况不妙，急忙开逃。卡西亚没有追，而是用最快的速度又在它身上“添”了几箭。由于箭头浸有剧毒的腹蛇毒液，独眼科摩多龙逃得越快，血液循环便越快，毒液攻心也就会更快。果然不出卡吉亚所料，独眼科摩多龙的脚步很快就慢了下来，整个身体也开始左右摇摆不定——毒液已开始起作用了！又跑了几步，它的脑袋开始往下垂——毒液攻心了！不出50米，随着轰的一声钝响，独眼科摩多龙重重地倒在了地上。卡吉亚不假思索地快步跑上前去，他要一刀砍下它的脑袋，并趁着它的血液还没停止流动，用它脖子中喷出的鲜血涂满自己的全身，这才足以洗刷自己保护妻子不力的耻辱。
复仇的怒火已经让卡吉亚头脑发热，他甚至忘了巨蜥蜴常用的一项求生绝活——诈死！手提利刃一步步走向独眼科摩多龙，10米、5米、3米、2米，卡吉亚来到独眼科摩多龙身前，将手中的长砍刀举过头顶，大喝一声后用尽全身力气对准它后颈部狠狠劈了下去。可就在这瞬间，倒在地上的独眼科摩多龙闭着的右眼突然睁开，呼的一声，它有力的长尾巴卷着地上的落叶向卡吉亚横扫过来。咔嚓一阵脆响，措手不及的卡吉亚右侧肋骨立马被砸断了4根，整个人也被扫得飞出3米开外，而手中那把砍刀也脱手飞到了远处的草丛里。一口鲜血吐了出来。卡吉亚这才发现，独眼科摩多龙已从地上爬了起来，张着大口，一边淌着口水一边低吼着一步步向他逼来。肋骨断裂的剧痛使卡吉亚无力动弹，他只得硬咬着牙，用手撑着地面一点点往后挪。突然，一股令人窒息的腥风袭来，独眼科摩多龙张着血盆大口扑了上来，卡吉亚不愧为雅图族第一勇士，只见他头一低，顺势从背后抽出一枝铁头箭向恶兽口中狠狠插去。只听独眼科摩多龙惨叫一声，尖锐的铁头箭深深地扎进了它的舌根。独眼科摩多龙这下暴怒了，它不顾一切地向卡吉亚身上压来，卡吉亚急中生智，向一棵树后面滚去。只听耳边咔嚓一声响，粗大的树干上顿时出现了一个椰子般大小的白森森的缺口！
卡吉亚的心悬在半空。看来，蛇毒在独眼科摩多龙体内还未能充分发挥作用，如果继续这样处于被动状态，恐怕挨不到它毒发自己就丧生其口了。情急之下，卡吉亚下意识地在自己的背囊中摸来摸去，希望能找到一件称手的武器。有了！当他的手指触到一个用软木塞塞得紧紧的竹筒时，他的心中顿时一亮，那是大半筒剧毒的腹蛇毒液呀！眼下，独眼科摩多龙的嘴已被箭刺伤，如果能把这筒毒液塞到它嘴里，毒液会马上顺着伤口急攻入脑，那时？？然而，此时的独眼科摩多龙大有不咬死卡吉亚誓不罢休之势。
正当卡吉亚退避不迭时，草丛中亮光一闪，是刀！他心中一喜，赶忙将那柄不知斩下了多少猎物头颅的砍刀操到了手里。卡吉亚的砍刀锋利无比，可在独眼科摩多龙厚实的鳞甲面前却发挥不了什么威力。三刀下去之后，独眼科摩多龙的背上只留下几条细细的血痕。
独眼科摩多龙张口向卡吉亚咬来，卡吉亚已无路可走，他索性把心一横，将砍刀交到左手，对准它仅存的右眼狠狠地捅去，右手则掏出那筒毒液，迅速用牙咬掉上面的软木塞后，毅然塞进了它的嘴里。“噗！”刀光闪过，血光飞溅，独眼科摩多龙顿时变成了瞎子。“啪！”负痛到了极点的科摩多龙大力一咬，盛有毒液的竹筒在它口中变得粉碎。“咔嚓！”卡吉亚伸进恶龙嘴里的右臂也一瞬间被咬断了。卡吉亚从科摩多龙右眼中抽出砍刀，奋力砍断自己的右臂。他知道，只有断臂才能避免侵入右臂的毒素扩散到全身。
卡吉亚拼尽最后一丝力气爬到一块大石头后面，科摩多龙还要进行最后的挣扎，无人敢挡其锋。此时此刻，这头科摩多龙完全变成了一个恶魔，它怒吼着左冲右扑，用牙、用爪、用尾向四周的一切发泄自己的怒火，发泄着自己的痛苦。折腾了半小时后，它身边10米内的地盘如同被暴风雨侵袭过似的一片狼藉，而它，也终于心有不甘地倒了下去……
卡吉亚从大石头后爬了出来，用仅存的左手握着砍刀，一点一点“锯”下了仇家的脑袋。
在爱丝的坟头，放着一颗科摩多龙的头颅。卡吉亚斜躺在爱丝的坟边，看着周围愤怒而惊恐的族人们，眼中闪过一丝嘲弄的目光。他知道他将会有什么样的命运，但他不在乎，因为他的心早已随着爱丝而去了。火光中，他仿佛又看到了爱丝那双深情的眼睛……